Hướng dẫn các trường hợp hoàn thuế GTGT dự án đầu tư theo Nghị định 181/2025/NĐ-CP

Hoàn thuế GTGT đối với dự án đầu tư là chính sách hỗ trợ của Nhà nước nhằm tạo điều kiện cho những doanh nghiệp mới thành lập từ dự án đầu tư và những doanh nghiệp có dự án đầu tư mới. Các cơ sở đang hoạt động sản xuất kinh doanh (SXKD) có dự án đầu tư mới rất quan tâm đến vấn đề hoàn thuế cho trường hợp này. Hãy theo dõi bài viết để có cái nhìn chi tiết nhất về vấn đề hoàn thuế giá trị gia tăng đối với dự án đầu tư mới.

1. Trường hợp được hoàn thuế GTGT dự án đầu tư

Căn cứ theo Điều 15 Luật thuế giá trị gia tăng số 48/2024/Qh15 và Điều 30 Nghị định 181/2025/NĐ-CP, cơ sở kinh doanh đảm bảo đáp ứng đầy đủ các yêu cầu dưới đây thì  hoàn thuế GTGT đối với đầu tư:

• Đã đăng ký kinh doanh, đăng ký nộp thuế GTGT theo phương pháp khấu trừ ;

• Cơ sở kinh doanh có dự án đầu tư (bao gồm dự án đầu tư mới, dự án mở rộng, hoặc dự án đầu tư chia thành nhiều giai đoạn hoặc hạng mục đầu tư) nếu có số thuế GTGT đầu vào phát sinh trong giai đoạn đầu tư chưa được hoàn thuế, sẽ thực hiện bù trừ với số thuế GTGT phải nộp của hoạt động sản xuất, kinh doanh đang thực hiện (nếu có).

  • Sau khi bù trừ, nếu số thuế GTGT đầu vào chưa được khấu trừ hết từ 300 triệu đồng trở lên, thì cơ sở kinh doanh được hoàn thuế GTGT.

  • Trong trường hợp dự án đầu tư đã hoàn thành (bao gồm cả các giai đoạn, hạng mục đã hoàn thành), nhưng cơ sở kinh doanh chưa thực hiện hoàn thuế GTGT phát sinh trong giai đoạn đầu tư, cơ sở kinh doanh phải nộp hồ sơ hoàn thuế GTGT trong 01 năm kể từ ngày dự án đầu tư hoặc ngày giai đoạn, hạng mục đầu tư hoàn thành.

• • Ngày hoàn thành dự án hoặc giai đoạn, hạng mục đầu tư: được xác định là ngày phát sinh doanh thu của dự án đầu tư hoặc ngày phát sinh doanh thu của giai đoạn, hạng mục đầu tư.

  • Doanh thu không bao gồm doanh thu phát sinh trong giai đoạn chạy thử, doanh thu hoạt động tài chính, thanh lý nguyên vật liệu của dự án đầu tư.

* Trường hợp cơ sở kinh doanh là chủ dự án đầu tư thành lập tổ chức kinh tế mới hoặc giao cho Ban Quản lý dự án, chi nhánh thực hiện quản lý dự án đầu tư:

• Tổ chức kinh tế mới thành lập, Ban Quản lý dự án, chi nhánh sẽ được khấu trừ và hoàn thuế GTGT đối với dự án đầu tư.

  • Tổ chức kinh tế mới phải bù trừ số thuế GTGT của hàng hóa, dịch vụ mua vào sử dụng cho dự án đầu tư với số thuế GTGT phải nộp từ hoạt động sản xuất, kinh doanh đang thực hiện (nếu có).

  • Sau khi bù trừ, nếu số thuế GTGT chưa được khấu trừ hết từ 300 triệu đồng trở lên, cơ sở kinh doanh sẽ được hoàn thuế.

• Bàn giao số thuế GTGT chưa khấu trừ hết sau khi hoàn thành dự án:

  • Khi dự án đầu tư, giai đoạn đầu tư, hạng mục đầu tư đã hoàn thành, nếu tổ chức kinh tế mới thành lập, Ban Quản lý dự án, chi nhánh không tiếp tục quản lý, vận hành hoạt động sản xuất, kinh doanh mà giao cho chủ dự án đầu tư hoặc cơ sở kinh doanh khác quản lý, vận hành, thì tổ chức kinh tế mới thành lập, Ban Quản lý dự án, chi nhánh phải bàn giao số thuế GTGT chưa khấu trừ hết cho chủ dự án đầu tư hoặc cơ sở kinh doanh mới để tiếp tục kê khai và khấu trừ cho kỳ tính thuế tiếp theo.

• Trường hợp dự án đầu tư chưa đi vào hoạt động nhưng phải chấm dứt hoạt động:

  • Nếu dự án đầu tư đang trong giai đoạn đầu tư chưa đi vào hoạt động sản xuất, kinh doanh nhưng phải chấm dứt hoạt động mà không phát sinh thuế GTGT đầu ra, cơ sở kinh doanh phải nộp lại số thuế GTGT đã hoàn vào ngân sách nhà nước theo quy định của pháp luật về quản lý thuế.

  • Đối với số thuế GTGT chưa được hoàn, sẽ không được giải quyết hoàn thuế.

Xem thêm: Thủ tục hoàn thuế GTGT mới nhất

2. Quy định về hoàn thuế GTGT dự án đầu tư của cơ sở kinh doanh ngành, nghề đầu tư có điều kiện

Đối với dự án đầu tư của cơ sở kinh doanh ngành, nghề đầu tư kinh doanh có điều kiện thuộc các trường hợp sau thì cơ sở kinh doanh được hoàn thuế giá trị gia tăng đối với dự án đầu tư theo quy định như sau:

• Dự án đầu tư trong giai đoạn đầu tư, theo quy định của pháp luật đầu tư, pháp luật chuyên ngành đã được cơ quan nhà nước có thẩm quyền cấp giấy kinh doanh ngành, nghề đầu tư kinh doanh có điều kiện theo một trong các hình thức: Giấy phép hoặc giấy chứng nhận hoặc văn bản xác nhận, chấp thuận.
• Dự án đầu tư trong giai đoạn đầu tư, theo quy định của pháp luật đầu tư, pháp luật chuyên ngành chưa phải đề nghị cơ quan nhà nước có thẩm quyền cấp giấy kinh doanh ngành, nghề đầu tư kinh doanh có điều kiện theo một trong các hình thức: Giấy phép hoặc giấy chứng nhận hoặc văn bản xác nhận, chấp thuận.
• Dự án đầu tư theo quy định của pháp luật đầu tư, pháp luật chuyên ngành không phải có giấy kinh doanh ngành, nghề đầu tư kinh doanh có điều kiện theo một trong các hình thức: giấy phép hoặc giấy chứng nhận hoặc văn bản xác nhận, chấp thuận.

Xem thêm: Tổng hợp từ A – Z quy định về khấu trừ thuế giá trị gia tăng

3. Quy định về các trường hợp không được hoàn thuế GTGT mà được kết chuyển số thuế GTGT chưa khấu trừ hết sang kỳ tiếp theo

Cơ sở kinh doanh không được hoàn thuế giá trị gia tăng mà được kết chuyển số thuế chưa được khấu trừ của dự án đầu tư theo pháp luật về đầu tư sang kỳ tiếp theo đối với các trường hợp:

• Dự án đầu tư của cơ sở kinh doanh không góp đủ số vốn điều lệ như đã đăng ký tại thời điểm nộp hồ sơ hoàn thuế.
• Dự án đầu tư của cơ sở kinh doanh ngành, nghề đầu tư kinh doanh có điều kiện khi chưa đủ các điều kiện kinh doanh theo quy định của pháp luật về đầu tư trừ trường hợp quy định tại mục 2 bài viết này.
• Dự án đầu tư của cơ sở kinh doanh ngành, nghề đầu tư kinh doanh có điều kiện không bảo đảm duy trì đủ điều kiện kinh doanh trong quá trình hoạt động là dự án đầu tư của cơ sở kinh doanh ngành, nghề đầu tư kinh doanh có điều kiện nhưng trong quá trình hoạt động cơ sở kinh doanh bị thu hồi một trong các giấy kinh doanh ngành, nghề đầu tư kinh doanh có điều kiện:
• • Giấy phép hoặc giấy chứng nhận hoặc văn bản xác nhận, chấp thuận;
  • Hoặc trong quá trình hoạt động cơ sở kinh doanh không đáp ứng được điều kiện để thực hiện đầu tư kinh doanh có điều kiện theo quy định của pháp luật về đầu tư thì thời điểm không hoàn thuế giá trị gia tăng được tính từ thời điểm cơ sở kinh doanh bị thu hồi một trong các loại giấy tờ nêu trên hoặc từ thời điểm cơ quan nhà nước có thẩm quyền kiểm tra, phát hiện cơ sở kinh doanh không đáp ứng được các điều kiện về đầu tư kinh doanh có điều kiện.
• Dự án đầu tư khai thác tài nguyên, khoáng sản (không bao gồm dự án tìm kiếm thăm dò, phát triển mỏ dầu khí quy định tại mục a) nêu trên) và dự án đầu tư sản xuất sản phẩm là tài nguyên, khoáng sản khai thác đã chế biến thành sản phẩm khác quy định tại khoản 14 Điều 4 của Nghị định 181/2025/NĐ-CP.

Kết luận

Như vậy, bài viết đã trình bày cơ bản sự khác biệt về quy định hoàn thuế GTGT từ dự án đầu tư theo quy định tại Nghị định 181/2025/NĐ-CP. Hy vọng bài viết này sẽ giúp các bạn hiểu hơn về quy định hiện hành và áp dụng đúng chính sách khi làm thủ tục hoàn thuế GTGT từ dự án đầu tư.

Phần mềm kế toán online MISA AMIS mang đến giải pháp quản trị tài chính kế toán tổng thể vừa đơn giản, thông minh vừa an toàn chính xác. Phần mềm cho phép kế toán doanh nghiệp:

• Hệ sinh thái kết nối: ngân hàng điện tử; Cơ quan Thuế; hệ thống quản trị bán hàng, nhân sự: giúp doanh nghiệp dễ dàng trong các nghĩa vụ thuế, hoạt động trơn tru, vận hành nhanh chóng
• Đầy đủ các nghiệp vụ kế toán: Đầy đủ 20 nghiệp vụ kế toán theo TT133 & TT200, từ Quỹ, Ngân hàng, Mua hàng, Bán hàng, Kho, Hóa đơn, Thuế, Giá thành,…
• Tự động nhập liệu: Tự động nhập liệu từ hóa đơn điện tử, nhập khẩu dữ liệu từ Excel giúp rút ngắn thời gian nhập chứng từ, tránh sai sót.
• Làm việc mọi lúc mọi nơi qua internet: giúp kế toán viên nói riêng và ban lãnh đạo doanh nghiệp nói chung có thể kịp thời đưa ra quyết định về vấn đề tài chính của doanh nghiệp.

Tham khảo ngay bản demo phần mềm kế toán online MISA AMIS dùng thử miễn phí 15 ngày  để quản lý công tác kế toán hiệu quả hơn.